ERC Consolidator Grant 2022 - Une lauréate à l'IBPS !

Elodie Laine, maîtresse de conférence Sorbonne Université dans l’équipe « Génomique Analytique » du LCQB, est lauréate du programme « ERC Consolidator Grant 2022 » pour son Projet PROMISE : Proteome diversification in evolution.

Ce financement prestigieux et très compétitif est accordé par le Conseil Européen de la Recherche (ERC) pour soutenir les chercheurs et chercheuses de l'Union Européenne en début de carrière, en leur fournissant les moyens nécessaires pour mener des projets de recherche innovants et ambitieux.

L’attribution de ce financement à Elodie Laine témoigne de la reconnaissance de ses contributions scientifiques exceptionnelles dans le domaine de la diversification des protéomes au cours de l’évolution. 

Elodie nous présente son projet :

Comment les protéines se sont-elles diversifiées à travers l'évolution ? Quelles combinaisons d’acides aminés jouent un rôle crucial dans leurs interactions ? Des traits comportementaux complexes, tels que l’apprentissage vocal, ont-ils émergé à partir d'innovations protéiques ou à travers la réutilisation de thèmes anciens ? 

Le projet PROMISE vise à répondre à ces questions en exploitant les masses de données de séquences et structures protéiques avec des techniques d’IA (Intelligence Artificielle) de pointe. Avec comme hypothèse de travail que les variations naturelles observées entre différents « protéoformes » (différentes variations d’une même protéine), issus d’événements de duplication (de différents gènes) ou d'épissage alternatif (d’un même gène), nous indiquent où et comment cibler les protéines pour moduler leurs interactions et le fonctionnement. 

Les résultats escomptés seront transférables à un large éventail de questions sociétales importantes, telles que la variabilité interindividuelle de la susceptibilité aux maladies, et la conception de médicaments plus spécifiques et de protéines de novo plus biocompatibles.

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Aperçu schématique de PROMISE. 

A. MSA classique (en haut) et réseau d'interactions (en bas).

B. Nouvelle intégration protéo-transcripto-génomique basée sur un graphe. Trois transcrits d'une espèce sont mis en évidence par des chemins colorés dans le graphe. Grâce à l'apprentissage de représentations guidé par l’évolution et la physique (cases en bleu), PROMISE (1) produira des réseaux d'interactions centrés sur les protéoformes, (2) identifiera les motifs convergents entre les humains et les pinsons zébrés, et (3) dévoilera les dépendances entre résidus modulant les interactions entre protéines.