Biophysique des micro-organismes

Nous étudions les bactéries de la cellule unique au niveau de la population. Nous profitons de leur échelle de temps de reproduction appropriée pour aborder des questions fondamentales et générales telles que les processus de mutation, les mécanismes physiques d'expansion des communautés et les relations causales liant les paramètres physico-chimiques de l'environnement et les réponses biologiques. À cette fin, nous concevons et mettons en œuvre des dispositifs microfluidiques destinés au suivi en temps réel de modèles bactériens vivants tels que Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Bacillus subtilis en utilisant la microscopie vidéo et l'analyse d'images. Notre approche repose sur la mise en œuvre de concepts issus des mathématiques, de la physique et de la physico-chimie pour réaliser des analyses quantitatives des processus ciblés.

Nos activités couvrent différents projets :

Futures directions

  • Imagerie locale de l'oxygène dans les biofilms bactériens basée sur la surveillance FLIM des traceurs fluorescents et l'illumination des nappes laser.
  • Caractérisation de la structure interne des colonies d'essaimage par imagerie de contraste.
  • Effet de l'âge, du stress et de l'infection sur la dynamique des mutations dans les mutations d'E. coli au niveau d'une seule cellule dans des conditions contrôlées et sur de grandes échelles de temps.
  • La distribution des effets de fitness des mutations (DFE) change avec les conditions environnementales. Expériences de "Microfluidic Mutation Accumulation" (?MA) dans la puce microfluidique "machine mère", et accumulation de mutations en l'absence totale de sélection naturelle.